Obrigado por se interessar em ajudar, mas ainda naum funcionou. Coloquei as linhas no javascript.php desta forma:tipo, se vc quiser usar javascript no PHP-Nuke, vá na pasta Includes e Javascript.php, lá coloque essas duas linhas que está pronto.... ou vá para o site http://phpnuke.org.br , tambem tenho acc lá......qualquer coisa, fala aí.....
echo"<script language=\"JavaScript\" src=\"modules/governo/inc/FerantLib.js\"> </script>";
echo"<script language=\"JavaScript\" src=\"modules/governo/inc/myWindow.js\"> </script>";
Continua dando erro do tipo DHTMLWindow1 não definido