Srs.
Eu estava com a mesma dificuldade para que a popup não perdesse o focus para a janela que a chamou, pra isso ficasse com o focus sempre.
após ler as dicas de nossos amigos fiz a pesquisa na msdn pelo objeto em questão <body> (http://msdn.microsof.../ms535205(VS.85).aspx)
e acabei usando este codigo em minha popup que deu o resultado que eu queria: <body onfocusout="document.focus();">
abs!