Bom primeiro dia no topico e já tenho mais ou menus umas 1000 perguntas

seguinte;
Criei um layout no fireworks e exportei em fatias (HTM), depois abri o dreamweaver e comecei a trabalhar
só que eu quero inserir comandos em php, quero fazer um gerenciador de servidores, pra controlar sarg, Ftp, Squid, Firewall (pra bloquear ip) e outros,
fiz assim, criei um arquivo ftp.php, squid.php e assim em diante e coloquei em link em cada um para chamar cada arquivo que carrega a mesma pagina e só muda o conteúdo abaixo, eu preciso colocar em menu fixo?
alguem sabe me explicar como interagir o php com HTML e como criar um menu fixo, ou qual a melhor maneira pra começa um projeto assim.
Se alguem poder ajudar, ficarei muito grato!
Obrigado a todos

o projeto é esse (não sei se pode deixar link) Projeto Php My Admin