Eu já testei com tamanho em porcentagem e não funciona exatamente do jeito que eu gostaria, vou dar uma exemplificada:
Menu1 Browser Maximizado:

Menu2 Browser com tamanho menor:

Nas figuras, o tracejado representa o browser.
O y é o height do logo.
O x a margin-top e margin-bottom do logo.
E z é o height total do DIV conteudo e o container dele.
O que eu gostaria é que, quando em tamanho menor de browser (funcionando também para resoluções diferentes de tela), o y e o x fossem sempre mantidos e o logo sempre visível.
O que diminuiria sempre seria o z, sempre mantendo o espaço em relação ao logo. Os Divs containers e conteudo sempre teriam o mesmo alinhamento de baixo, mantendo seus bottoms na mesma posição.
Dentro do conteudo, existiria um scroll caso necessário.
Isso, através do meu código, funcionava no Firefox. Da maneira que se encontra no FF, eu gostaria de fazer no IE.
Se eu utilizar porcentagem, a distância x será variável e o conteúdo, onde ficaria a TreeView, dependendo da resolução, ultrapassa o limite do logo e fica com altura variável em relação ao fundo dela. Sacou?
Qualquer sugestão eu agradeço!
Abs a todos!