E aí, gente

Sou iniciante em programação e tenho uma dúvida que, para muitos, será considerada básica.
Trabalho com um site de e-commerce no qual foi lançada agora uma versão específica para atacado. Para isso, foi criado um subdomínio, que replica todas as páginas praticamente iguais.
Para contornar o problema perante ao Google, que não vê com bons olhos práticas de repetição de páginas, decidimos utilizar a tag canonical em todas as páginas do subdomínio, apontando para sua página correspondente na versão original do site.
Agora preciso saber: há uma forma de criar uma regra que insira essa tag no head de todas as páginas automaticamente, com a condicional de direcionar sempre para a URL sem o domínio?

Valeu!